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支持向量机方法预测七鳃鳗miRNA前体
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| 【文章作者】张洁;李庆伟;邹丽; |
| 【文章摘要】 将七鳃鳗miRNA前体(pre-miRNA)序列的结构特征作为支持向量机工具Lib-SVM的输入向量,经Grid程序优化参数后,开发序列预测程序Lj-miRSVM,通过10倍交叉法验证,平均敏感性和特异性分别为95%和95.9%,准确率为95.8%,接收者操作特征曲线(ROC)下的面积比约为98.9%。用Lj-miRSVM预测其他20个物种的pre-miRNA,平均正确率为78.5%。 |
| 【关 键 字】七鳃鳗;;支持向量机;;miRNA前体预测;;ROC曲线 |
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【期刊】济南大学学报(自然科学版)【卷】【ISSUE】【ISSUEID】
【文章期份】2015
【发布日期】2015/3/19 0:00:00
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